A partir de 1310, tras el proceso contra el temple celebrado en Medina del Campo, los bienes de los templarios se repartieron entre los monarcas, nobles y obispados. Todo parece indicar que Ceinos, pasó a manos de D. Alfonso de Alburquerque. Pronto, D. Alfonso perdería su reputación ante el rey y dejaría Ceinos en poder de la familia Bazán. Posteriormente, la villa de Ceinos, quedaría en propiedad del almirantazgo de Castilla, por orden del rey Enrique, en concreto, en poder de D. Fadríque, su hijo bastardo, en pugna con la familia Bazán por su propiedad.

La llegada al trono de los Reyes Católicos junto al descubrimiento de América y especialmente, la toma de Constantinopla por los turcos, marcan la línea divisoria entre las edades media y moderna. En este caso, las investigaciones sobre Ceinos, han sido orientadas hacia los archivos de la época, advirtiendo sobre el poco tiempo dispuesto, y quedando a disposición de los interesados, investigaciones más profundas de estos siglos y posteriores. Al fin y al cabo, el único objetivo del que suscribe, es poner el primer grano de arena en esta historia. Existen muchas referencias en los archivo de Simancas, Real Chancillería y de Indias, principalmente, de los que he extraído las más relevantes y curiosas; siempre a falta de una investigación exahustiva de los archivos eclesiasticos del Arzobispado de Valladolid que pudieran deparar más de una sorpresa.
De mediados del siglo XV, conocemos el largo pleito entre el almirantazgo de Castilla y la familia Bazán, por la posesión de Ceinos, que no se resolverá hasta bien entrado el siglo XVI. Sobre este asunto, en el Archivo General de Simancas, y en la Real Chancillería de Valladolid, constan los siguientes asientos: